免疫・炎症疾患の多くは原因不明であり、残念ながら原則として（病気を消し去ることができるような）根治治療はありません（ただし不適切なライフスタイルが発病に関わることがありますので食事・ストレス・運動・睡眠の管理は欠かせません）。既存の病気の概念では説明できないような（診断確定に至らないような）病状のこともあり、未解決の医学領域だと言えます。そのため、薬を使用しながら長きにわたって「病気と上手に付き合う」ことを目指していただくことになります。治療には、暴走した免疫力を抑え込むような薬（表2）が用いられます。治療が進歩し現在も毎年のように新薬が発売され、良好に管理できることがますます増えている一方で、薬の副作用への対応を迫られることもある点には注意を要します。